Οι ειδικές δομές των μικροσκοπίων φθορισμού περιλαμβάνουν:
(1) Σύστημα φίλτρου χρώματος
Το μπλοκ έγχρωμου φίλτρου είναι ένα σημαντικό μέρος ενός μικροσκοπίου φθορισμού και τα βασικά του συστατικά αποτελούνται από ένα πρώτο φίλτρο φραγμού για το φως διέγερσης, ένα δεύτερο φίλτρο φραγμού για το φως εκπομπής και έναν καθρέφτη διαχωρισμού δέσμης. Τα μοντέλα φίλτρων χρώματος και τα ονόματα διαφόρων κατασκευαστών είναι συχνά ασυνεπή.
1. Φίλτρο φωτός διέγερσης και φίλτρο φωτός εκπομπής: Με βάση τα χαρακτηριστικά της πηγής φωτός και της φθορίζουσας χρωστικής, επιλέγονται συνήθως οι ακόλουθοι τρεις τύποι αντιστοίχισης για να παρέχουν φως διέγερσης σε ένα συγκεκριμένο εύρος μήκους κύματος και να επιτρέπουν στον φθορισμό που διεγείρεται από το δείγμα να περάσει και να φτάσει στον προσοφθάλμιο για απεικόνιση.
Διέγερση UV: Το φίλτρο φωτός διέγερσης μπορεί να επιτρέψει στο υπεριώδες φως να περάσει και να εμποδίσει τη διέλευση του ορατού φωτός άνω των 400 nm. Το αντίστοιχο φίλτρο φωτός εκπομπής επιτρέπει στο μπλε φως να περάσει και το φως στο οπτικό πεδίο εμφανίζεται μπλε, όπως όταν εφαρμόζεται στη χρώση DAPI.
Διέγερση μπλε φωτός: Το φίλτρο φωτός διέγερσης μπορεί να επιτρέψει στο μπλε φως να περάσει και να εμποδίσει το φως από άλλα μήκη κύματος. Το αντίστοιχο φίλτρο φωτός εκπομπής επιτρέπει τη διέλευση του πράσινου φωτός, όπως δείκτες χρώσης GFP.
Διέγερση πράσινου φωτός: Το φίλτρο φωτός διέγερσης επιτρέπει στο πράσινο φως να περάσει και εμποδίζει το φως από άλλα μήκη κύματος. Το αντίστοιχο φίλτρο φωτός εκπομπής επιτρέπει συνήθως τη διέλευση του κόκκινου φωτός, όπως η χρώση με ροδαμίνη.
2. Ημιδιαφανές και ημιανακλαστικό φίλτρο χρώματος: Η λειτουργία του είναι να εμποδίζει εντελώς το φως διέγερσης να περάσει και να το ανακλά. Και εκπέμπουν φως εντός του αντίστοιχου μήκους κύματος. Το μοντέλο του αντιστοιχεί στο φίλτρο φωτός διέγερσης και στο φίλτρο φωτός εκπομπής.
(2) Αντικειμενικός φακός και προσοφθάλμιος φακός
Μπορούν να εφαρμοστούν διάφοροι αντικειμενικοί φακοί, αλλά είναι καλύτερο να επιλέξετε φακούς με πρόσθετη κλίμακα και μείωση χρωματικής εκτροπής, καθώς ο αυτοφθορισμός τους είναι εξαιρετικά χαμηλός και η απόδοση μετάδοσης φωτός (εύρος μήκους κύματος) είναι κατάλληλη για φθορισμό. Λόγω του γεγονότος ότι η φωτεινότητα φθορισμού μιας εικόνας στο πεδίο του μικροσκοπίου είναι ευθέως ανάλογη με το τετράγωνο του λόγου διαφράγματος του αντικειμενικού φακού και αντιστρόφως ανάλογη με τη μεγέθυνσή του, για να βελτιωθεί η φωτεινότητα των εικόνων φθορισμού, θα πρέπει να χρησιμοποιηθεί αντικειμενικός φακός με μεγαλύτερο λόγο διαφράγματος. Ειδικά για δείγματα με ανεπαρκή φθορισμό, θα πρέπει να χρησιμοποιείται αντικειμενικός φακός με υψηλή αναλογία διαφράγματος και υψηλή διαπερατότητα φωτός, συνοδευόμενος από προσοφθάλμιο φακό με τη μικρότερη δυνατή μεγέθυνση.
(3) Άλλες οπτικές συσκευές
Το ανακλαστικό στρώμα ενός καθρέφτη είναι συνήθως επικαλυμμένο με αλουμίνιο επειδή το αλουμίνιο απορροφά λιγότερο υπεριώδες και ορατό φως στην μπλε μοβ περιοχή, αντανακλώντας πάνω από 90% (ενώ το ασήμι έχει ανακλαστικότητα μόνο 70%). Γενικά, χρησιμοποιούνται επίπεδοι καθρέφτες. Ο φακός εστίασης, ειδικά σχεδιασμένος και κατασκευασμένος για μικροσκόπια φθορισμού, είναι κατασκευασμένος από γυαλί χαλαζία ή άλλο γυαλί που μεταδίδει υπεριώδες φως. Η συσκευή πτώσης φωτός, εκτός από το ότι έχει τη λειτουργία μιας πηγής μετάδοσης φωτός, είναι πιο κατάλληλη για άμεση παρατήρηση αδιαφανών και ημιδιαφανών δειγμάτων, όπως παχιά φύλλα, μεμβράνες φίλτρων, αποικίες βακτηρίων, καλλιέργειες ιστού και άλλα δείγματα. Τα τελευταία χρόνια, πολλοί νέοι τύποι μικροσκοπίων φθορισμού έχουν αναπτυχθεί χρησιμοποιώντας μια συσκευή πτώσης φωτός, γνωστή ως μικροσκόπιο φθορισμού φωτός πτώσης.
